微生物在大家日常生活的自然环境中无所不在，但一直以来，他们一直做为发病源而造成大家的留意。事实上，大家的表皮和肠胃中也日常生活着很多微生物，他们并不会使大家得病，反倒对大家的身心健康起着关键功效，殊不知，这种小微生物与人类关联的紧密水平却不为人知。

身体微生物的类型有数千种，其总数是大家本身体细胞数量的1到10倍。大家常说身体内寄生着很多微生物，而更除此以外法是，他们与大家相互依存。早在人类在地球上走动以前，动物与微生物就创建起各种各样互利共生关联——动物体为微生物出示维护及营养丰富的生存条件，做为收益，微生物则充分发挥其遗传基因优点，协助动物溶解营养元素、合成维他命等。在悠长的演变全过程中，向微生物“借遗传基因”是动物得到超级技能的一条近道。

有生物学家把身体的微生物生态系统看作是一个近期发觉而仍待探寻的“人体器官”，由于他们参与着大家不可或缺的各类生理学全过程。例如，定居在肠子中的一些微生物能合成人类本身没法合成的B族维生素。维生素b21、B2、B7是体细胞氧化磷酸化需要的辅因子，维生素B6在碳水化合物合成中饰演关键人物角色，维生素b29参与核苷酸的合成……这种生化反应针对微生物和人类而言都尤为重要，因此 ，B族维生素是微生物和人类相互需要的。殊不知，也有一些微生物遗传基因确是一心一意地为人类服务项目，例如，肠道微生物合成的维生素B12能够 协助人类凝血功能，对微生物本身却用途并不大，这还可以看作是一个微生物和人类共同进化的证实。

结肠中的微生物能够 溶解人类没法消化吸收的营养元素，使其便于被身体消化吸收。肠道微生物们是溶解木薯淀粉、甲基纤维素、绵白糖等糖分的高手，据统计，身体消化吸收的热量大约有10%是在微生物的帮助下进行的，要是没有他们，这种营养元素就只有穿肠经过。肠道微生物还会继续代谢信号分子到人体血液中，参与大范畴的新陈代谢管控。从肠道微生物释放出来的信号分子不但参与调整肝部和肌肉细胞对动能的存储和运用，还能危害身体对甘精胰岛素的反映性，乃至参与管控大家的胃口和休重。一个实际的事例是大家肠子的病菌在溶解食材中的甲基纤维素时，会造成蚁酸，蚁酸根据血液系统抵达肾脏功能，调整盐新陈代谢，进而危害大家的心率。

肠道微生物不但协助大家消化营养成分、参与人体的新陈代谢管控，他们乃至危害着大家人体的免疫力功能。微生物危害人体免疫作用的方法有很多：最先，微生物生长发育时候代谢抑止别的微生物生长发育的化学物质，因此 ，人体正常有益菌的均衡能够 协助大家抑止别的病原菌的入侵。此外，微生物在人体免疫系统生长发育的全过程中起着一定功效。试验发觉，在无菌检测自然环境中长大了的小白鼠结肠周边的淋巴组织生长发育混乱，沒有一切正常小白鼠所具备的毛细管系统软件，身体的抗原也非常少。值得一提的是，微生物还会继续不断“训炼”大家的人体免疫系统——有利的肠道微生物能提高大家身体的抗原合成，另外能提升寄主人体免疫系统对本身微生物和本身体细胞的鉴别忍受，进而减少本身免疫疾病的产生。除此之外，肠道微生物还能合成一些抗感染化学物质，抑止过多的免疫反应。值得一提的是，研究发现，发炎发病率低的个人，患癌病的风险性也较低。

肠道微生物还会继续危害脑部发育、调整大家的心态。一些微生物能合成脑部发育需要的不饱和脂肪ARA和DHA，这种化学物质是神经细胞生长发育和保持需要的关键成份，人类本身没法合成，只有从食材摄入或依靠肠道微生物的协助。此外，大家的肠胃周边有很多神经结，他们根据交感神经与人的大脑相接，产生脑-肠神经系统轴。肠道微生物能够 合成GABA、5-5羟色胺、褪黑色素、乙酰胆碱等递质，参与大家神经中枢系统软件的调整，从而危害大家的心态和认知能力个人行为。